陸上競技の大会で芦屋瑞稀（前田敦子）が声援を送るなか、佐野泉（中村蒼）は見事なハイジャンプを見せ、大会新記録を出した。しかし、瑞稀が女であることがついに学園長たちの耳にも入ってしまった。
　大会が終わり、瑞稀が部屋に戻ると、佐野と中津秀一（三浦翔平）が待っていた。2人には桜咲学園を出て行くことを告げ、瑞稀は荷物を持って寮を後にする。
　瑞稀が思い出の詰まった学園の教室に向かうと、そこに保健医の梅田北斗（斎藤工）が現れ、これまでの3カ月間の思いを吐き出せ、と言われ…。
　瑞稀が出て行った後、寮生たちはいよいよ迫った廃校式を控え、寮の片付けや掃除に追われる。すると花屋敷ひばり（岩佐真悠子）や神楽坂真言（佐藤祐基）が訪ねてきた。今回の騒ぎで寮長3人が退学させられるところを、瑞稀一人で責任を取ったらしい、という話を神楽坂から聞き、自分たちが瑞稀に何かを返さなければ、という思いに駆られた3寮長はじめ寮生たちは…。