流田縁（香取慎吾）は失った記憶を探るため、永友エミリ（倉科カナ）にプロポーズした教会を訪ねる。なぜエミリは殺害されてしまったのか？その答えを見つけることも出来ない。そんな縁の行動を監視する者がいた。警視庁捜査一課の柏木夏生（谷原章介）たちだ。かつてエミリと仕事仲間だった柏木が縁に向ける眼光は鋭い。
一方、千代田科捜研では石巻桜子（西内まりや）がアルバイトを始めたが、慣れないことばかり。そんな時、所長の千代田真紀（鈴木保奈美）は縁、桜子、松井丈太朗（中山優馬）に科捜研のチラシ配りを命令。縁たちは街頭に立つが、なかなかチラシを受け取ってくれる人がいないまま昼食の時間になる。3人はラーメンの名店『雷麺』に行くことになった。
縁たちが『雷麺』に着くと、店の周囲には警官がいて規制線が張られている。どうやら、強盗が入ったらしい。最近発生した別の事件で警察の科捜研が多忙と話す鑑識係に縁が声をかけ、『雷麺』の主人が運び込まれた病院へ。そこにいた事件の担当刑事、園田和夫（七枝実）と話した縁は、この事件の捜査依頼を受けることに成功する。
千代田科捜研にはさっそく『雷麺』強盗事件の資料が持ち込まれ、縁たちの捜査が始まる。すると『雷麺』は、強盗を偽装した犯人が別の目的で侵入した疑いが出て来た。捜査を進めると『雷麺』を批判する石井祐二（天野ひろゆき）という男がインターネットから浮かび上がる。