流田縁（香取慎吾）や石巻桜子（西内まりや）たち千代田科学捜査研究所のメンバーは、一ノ瀬栄造教授（柴俊夫）を殺害したのは行方不明中の元研究員、大島隆二（橋野純平）であることを突き止めた。情報を受けた柏木夏生刑事（谷原章介）らは、大島が整形していることを確認。整形後の顔写真を千代田科捜研に送った。写真を見た縁たちは驚く。その顔は、千代田科捜研のビル管理人、白石慎太郎（小松利昌）だった。
千代田真紀（鈴木保奈美）は、白石と仲が良かった千代田くるみ（濱田ここね）を探すが姿はない。桜子もいなくなっていた。そんな時、事務所の電話が鳴る。白石＝大島からだ。桜子とくるみの誘拐を認めた白石は、電話に出た縁に永友エミリ（倉科カナ）が残した反証データを渡すよう迫る。エミリ殺害を暗に認める大島は、縁に桜子たちを助けたいなら、反証データを持って来るよう告げて電話を切った。
記憶の戻らない縁にデータの所在はわからない。田坂繁（イッセー尾形）は、縁に何とか思い出すよう促す。悩む縁は、事件前に真紀がエミリに電話で言われたという言葉を思い出した。“必ず帰るから、教会で待っていて”。教会へと向かった縁が、かつてエミリが手入れしていた花壇を調べると、USBメモリが埋められていた。そんな縁に、大島は電話で中身の確認を要求。だが、メモリにはパスワードが必要なロックがかかっていて…。