自分の持つ能力に悩んでいる猿島マリア（小島藤子）を放っておけない山田竜（山本裕典）は、滝川ノア（松井愛莉）から魔女伝説ノートの下巻に書かれていたという“魔女殺し”の話を聞き、生徒会長の山崎春馬（徳山秀典）と話をつける為、生徒会室に向かう。
魔女伝説ノートの下巻を見せて欲しいと頼む山田をのらりくらりとかわす春馬。業を煮やした山田は強行突破を試みるが、生徒会長秘書の飛鳥美琴（小林涼子）が立ちはだかる。
美琴に拘束されてしまった山田は、この状況から脱出しようと美琴の隙を突いてキスをする。入れ替わって脱出しようという作戦だった。ところが…。
何も知らず生徒会室を訪れた小田切寧々（大野いと）と五十嵐潮（間宮祥太朗）そしてマリアから山田の行き先を聞いた宮村虎之介（井出卓也）のおかげで難を逃れた山田は、白石うらら（西内まりや）と伊藤雅（トリンドル玲奈）が待つ超常現象研究部室に戻り、生徒会室で起こった出来事を話す。美琴が魔女かも知れないという話の内容に興味津々の雅は能力を確かめようと山田にキスをするが…。
魔女伝説ノートの下巻を手に入れることができず、“魔女殺し”の正体も分からない山田はマリアに「もう少し時間が欲しい」と告げる。そんな山田の気持ちがうれしいマリアは、ついつい習慣で山田にキスをしてしまう。呆然とする山田、その瞳から流れる涙。山田は初めて自分の気持ちに気付く。山田が見た未来とは…。