リトレイド貿易の渡辺（戸田昌宏）の密輸取引現場にて、警察に身柄を拘束された兵悟（福士蒼汰）。警察の取り調べで阿久津（りょう）と面会した兵悟は、今回の一件が、かねてから阿久津を快く思っていなかった遠藤（小市慢太郎）の仕業だと知る。遠藤はD班の存在をあぶり出し、数々の功績を上げる阿久津をつぶそうと考えたのだ。

その翌日、兵悟は警視庁への移送中に護送車から脱走。身を隠しながら反撃のチャンスをうかがっていると、テロ騒動の発端となった爆発事件の犯人について、あることに気付く―。兵悟からメッセージを受け取った伊達（安藤政信）は、兵悟が遠藤に反撃するつもりだと直感。しかし、兵悟が遠藤を狙う理由はほかにもあり…！？

警察組織の一新をもくろむ阿久津を突き動かす過去の惨劇、兵悟と阿久津をつなぐ謎の男の正体、さらに、将（野村周平）の知られざる過去とは！？D班発足の裏に隠された真実―、ついにその全貌が明らかに！