時空迷宮をさまよっていたロックは、火の鳥に救われ地球に舞い戻る。火の鳥はロックが自分の力をどう使うか見届けようとしていたのだ。古代遺跡の眠るフェニックス島に戻ったロックは、島に住む学者、リヨン博士を超能力で操って、アトムとお茶の水博士を調査の為と偽って、島に呼び寄せる。そうと知らず島にやってきたアトムと博士。アタミ教授とともに遺跡の調査に向かうが、そのアタミ教授が突然お茶の水博士を古代の牢獄に閉じ込めてしまう。アタミはロックの変装した姿だったのだ。
　再び超人類になるためにアトムを利用とするロック。お茶の水博士を救うためには言いなりになるしかないアトム。そして、ついに超人類になるための扉がロックの前に現れた。ロックがその扉に手を触れたその時…。