心中と思われる若い男女の遺体が発見された。第一発見者は、内海晴香（重廣礼香）の婚約者・山原哲司（黄川田将也）で、晴香と一緒に死亡した男は晴香の元恋人・猪俣政典（中村邦晃）だという。晴香のストーカーだった猪俣に動機も物証もあることから、猪俣による無理心中と断定されるが、伊達一義警部（堺雅人）は腑に落ちない。早速、伊達は宮城あすか（杏）を連れて山原に会う。山原は、猪俣が晴香に付きまとい暴力を振るうこともあったようだと証言。晴香はそんな男をなぜ部屋に入れたのだろうかと尋ねる伊達に、山原は、自分や周囲の目を気にしていたんだろうと答える。
　同じ頃、ルポライター・片桐冴子（りょう）は、井筒将明（鹿賀丈史）を訪ね、過去に17人の事件の容疑者が行方不明になっている“神隠し”について切り出す。それらの事件のうち2件はマスコミに公表されていないことから、冴子は、警察内部の人間が関与する可能性もあると言う。
　一方、伊達が山原の完璧なアリバイの前に行き詰まりを感じていると、鑑識官の久遠健志（錦戸亮）が現われ、布団で遺体を包めば死亡推定時刻を操作できると助言。しかし、現場にそんな痕跡は残されていなかった。
　後日、あすかと晴香の実家を訪ねた伊達はあることに気づく…。