警察のスキャンダルを追っていた新聞記者・芹沢詩織（石井杏奈）の転落事故死の真相が、脅迫者Xの正体につながるかもしれないと捜査を進めていた湯川班。そのさなか、湯川（沢村一樹）の情報屋で、転落事故について探っていた片桐（米本学仁）が何者かに殺された。遺体の第一発見者となった湯川は容疑者となり、そのことに納得がいかない湯川班は、捜査から外される。信頼する上司が犯人扱いされたことに怒りがおさまらない中西（徳重聡）は、湯川の無実を証明しようと、上の命令に背いてでも捜査すると宣言。しかし、冷静さを欠いた行動をたしなめるさゆり（松本まりか）と険悪なムードになり、湯川班はバラバラになってしまう。

その頃、円（橋本環奈）も、片桐を殺害し、美和（前野えま）を悲しませた犯人に怒りを覚えていた。さらに、約束通り経費20％削減を達成したにも関わらず、榊山官房長（福井晶一）から万町署が予定通り統廃合されると告げられ、ショックを受ける。自分が本庁からの特命を断ったせいだと責任を感じる円は、万町署を守りたい一心で、ある人物のもとを訪ねる。

一方、湯川は、「Xの正体がわかった」と片桐が言い残して死んだことから、警察の監視下を抜け出し、Xについて独自に調べを進めていた。同じく円も、1億円盗難事件を足がかりに、Xの正体を暴こうと動き出す。すると、1億円が盗み出された当日、署内で怪しい動きをしている人物がいて…。