またしてもデスクで眠ったまま朝をむかえてしまった桜木泉（上戸彩）。4係はでテレビで流れる、前日に起きた蒲田の河川敷で女性の遺体が発見された事件のニュースを見ていた。出社してきた深沢ユウキ（丸山智己）は、深刻な顔を浮かべそのまま長嶋室長（北大路欣也）を訪ねる。そして、4係は8年前に起きた事件の再捜査に着手することに。
　2002年、1カ月の間に4人の若い女性が立て続けに殺害される事件が起きた。遺体にはすべてナイフでGODという文字が記され、髪が切り落とされていたことから“神の処刑事件”と言われ世間を震撼させたが、4人目の殺害を最後に犯行はピタリと止まっていた。
　河川敷で発見された遺体が、神の処刑事件と類似点があることから4係で再捜査をすることになったのだ。ただし、相違点も多く、同一犯である確証が得られないまま捜査がスタートする。
　河川敷の遺体発見現場に向かった高峰涼子（山口紗弥加）と深沢だが、殺人犯係の捜査員は邪険に扱い、捜査状況や情報を教えてくれない。同じ頃、塚本圭吾（宮迫博之）と泉は、8年前の被害者の1人・田口成美（大矢敦子）の父親・健史（遠藤たつお）を訪ねていた。事件を引きずり、家庭が崩壊した健史の現状を目の当たりにして胸を痛める泉。
　泉たちが4係へ戻ると、殺人犯係の係長・古賀（矢島健一）が倉田工（杉本哲太）と対峙していた。古賀は河川敷の事件は容疑者の目星がついてるため4係に邪魔をされるのは迷惑だと言い、情報は渡せないと帰っていく。
　その夜、泉が科捜研を訪ねると、深沢もやってくる。今回の事件と“神の処刑事件”の関連に妙にこだわる深沢を興味津々にみつめる大森紗英（北川弘美）。そんな中、竹林匠（木村了）が証拠品から、当時は発見されていなかったあるものを見つける…。