ここのところ事件もなく平和な日々の捜査一課。しかし、姫川玲子（二階堂ふみ）はそれが不満なのかイライラと動き回り、仕事を求めていた。菊田和男（亀梨和也）や湯田康平（中林大樹）は不謹慎だと諌めるが、玲子は彼らの言葉が耳に入らない様子で、石倉保（宍戸開）に今朝発生した事案を尋ねる。玲子はこれが大きな事件に発展すると読んでいた。そんな時、橋爪俊介管理官（岡田浩暉）と今泉春男係長（山口馬木也）が特別捜査本部を立てると来た。玲子の勘は的中した。

捜査本部が立てられたのは蒲田西署。亀有北署から異動になったと井岡博満（今野浩喜）もいた。井岡は蒲田西署の葉山則之（葉山奨之）を玲子たちに紹介する。会議が始まると今泉が今朝の事案を説明。多摩川土手の路上に放置されたスクーターの荷台から、成人男性の左手首が発見される。三島耕介（堀井新太）の証言と指紋から、手首は高岡賢一（寺脇康文）のものと判明。高岡は工務店を経営していて、耕介は従業員。耕介が出勤すると工務店のガレージの床が血の海になっていたため、高岡を探していたのだ。

早速、玲子が体などは川に遺棄されたのだろうと発言しだすと遮るものが現れる。日下守（神保悟志）だ。予断は捜査の妨げになると言う日下に玲子は反論しようとするが、橋爪に止められる。
なぜ高岡は殺されたのか。そして、なぜ手首だけが残されていたのか？死体なき殺人事件の真相を追う姫川たちの前に、次々と驚がくの真実が浮かび上がっていく……。