1999年1月3日放送『鶴瓶・三宅のふたりはうさぎ年』が大変好評を博したのを受け、若き血、南原清隆を迎え、40代鶴瓶＆30代南原のホストで送る、今世紀最後の大型トーク番組、それが『鶴瓶、南原の日本のよふけ』です。

　『うさぎ年』の3人の顔パネルが登場し、そのうちの誰がスタジオに現れるのか分からないという画期的システムをそのままにさらに内容はパワーアップ！規制のトーク番組のようなゆるいゲストはスタジオに入れません！「エッ！？何でこんな人出てるの！？」という強力ゲストが毎週やってくるのです！