時多駿太郎（松本潤）は、何者かに連れ去られた藤崎瞳子（松嶋菜々子）の行方を捜査してほしいと警察署に駆け込むが、桐原由貴（吹石一恵）に断られてしまう。
駿太郎は、負傷して入院中の旭淳平（大泉洋）にそのことを報告。淳平は、警察に八神コーポレーションと通じている者がいる、八神コーポレーションの八神景介（鹿賀丈史）こそが、瞳子の父・眞人が死の直前まで調べていた男だと話した。その後、駿太郎らを前にした筑紫昌義（角野卓造）は、16年前、弁護士だった眞人が八神の土地買収にまつわる不正の証拠を掴んだ直後に、不審な死を遂げたのだと明かした。そんなとき、駿太郎、筑紫、水野飛鳥（仲里依紗）、茅野メイ（入来茉里）の携帯電話に、瞳子を誘拐した犯人からメールが届く。犯人は、瞳子と引き換えに眞人の手帳を渡すよう指示。その後、指定場所で飛鳥が待機していると、駿太郎にボディーガードを頼んだ史織（夏帆）が現れ手帳を受け取った。史織は、バイクに乗った男にそれを手渡した。
男を見送った駿太郎らは、手帳に付属した万年筆に仕掛けたGPSで手帳の行方を追う。追跡を続けるとGPSは、海上の客船の上で止まった。早速、駿太郎と飛鳥は船内に潜入する。
その頃、船内に拉致されていた瞳子の元へ、手帳を手にした男（永井大）が現れた。それは、瞳子を付け狙っていた男だった…。