ついにゲームが始まった。新出敏郎（坂口健太郎）に与えられた指令、それは「事件の首謀者を確保すること」。
沙織（桜井ユキ）を救うため、単独で事件の手掛かりを追う新出。新出自身のことを容疑者としてマークするSIT（特殊犯捜査係）の追跡を振り切り、沙織の行きつけのキッチンカー店主・上村園美（尾野真千子）や記者の明菜（岡崎紗絵）から情報を集めるが、犯人の動機や目的は一向に掴めない。
やがて、新出は事件の直前に地下鉄で出会った不思議な青年（笠松将）の存在に思いあたり、街の監視カメラ映像から男の居場所を特定する。

一方その頃、ソウルのゲーム参加者である医師のハン・キジュ（イ・ジュンギ）は、娘リアン（チェ・ソユル）を守れなかったことを、妻のナム・アユン（キム・ジェギョン）から激しく責められていた。キジュは与えられた指令を達成しようと目論むが、己の良心と娘への愛情との間で激しく葛藤する。

そんな中、ついにマニラの参加者であるタクシードライバーのミゲル（ジョエル・トーレ）が動いた。孫娘を人質に取られたミゲルは、人生の全てを賭けた勝負に出る。貧しさに苦しんだ過去ゆえに、金に執着し続けてきた彼への指令は「現金1，000万ペソを用意すること」――。

しかし新出たち参加者は、これが決してただの遊びではなく、人の命の懸かった「kiDnap GAME」なのだということを思い知らされるのだった。