動物と会話が出来ることが世間に知れ渡り、忙しい日々を送っていたドクター・ドリトルの元に森に住むビーバーからメッセージが届く。それは森の木が人間によって伐採され、動物たちの住処が危機に瀕しているというSOSだった。そこで気のいいドリトルは森に一頭しかいないメス熊に子供を作らせて法的に森を保護しようと思いつき、同種のオス熊を探し、お見合いを計画するがそのオス熊は野生を失っており、たくましくすべく猛特訓をはじめるのだが…