2011年。とある教会。流田縁（香取慎吾）は、永友エミリ（倉科カナ）にスターチスと紫のアネモネの花束を捧げてプロポーズ。しかし、数日後、縁は暗闇の中で目を覚ます。なぜか傷だらけの縁の視界に入ってきたのは、倒れているエミリの姿。なぜ自分とエミリがそんな場所にいるのか？縁は理解できずにいる。そこに、刑事たちが飛び込んできて…。
2014年。満員のエレベーターで石巻桜子（西内まりや）が痴漢に遭う。エレベーターの扉が開くと、桜子は隣に立っていた鹿戸澄夫（菊池均也）の腕をつかんで痴漢だと叫んだ。澄夫は無実を訴えるが、駆けつけた警備員に連れて行かれそうになる。そこに、もじゃもじゃ頭の男が現れ、無実なら証明すると告げて名刺を差し出した…縁だ。縁は千代田科学捜査研究所という民間の科捜研で働いている。わらにもすがる思いの澄夫に捜査を依頼された縁は、桜子のスカートに残された指紋から無実を証明して見せ、真犯人も突き止めた。しかし、報酬をもらうはずの澄夫は、いつの間にかいなくなってしまう。
科捜研に戻った縁は、所長の千代田真紀（鈴木保奈美）に報酬を取れなかったことを叱咤される。真紀の怒りは松井丈太朗（中山優馬）、小宮山祥子（安藤玉恵）、田坂繁（イッセー尾形）たち所員にも飛び火した。
次の日、桜子が科捜研を訪ねて来た。桜子は、父が亡くなった火事の原因を突き止めて欲しいと縁たちに依頼する。