科学者のブルース・バナー（エドワード・ノートン）は、恋人ベティ・ロス（リヴ・タイラー）の父、ロス将軍（ウィリアム・ハート）の命令を受けて人体への放射線抵抗を研究していた。研究の成功を確信し自らの肉体を使って実験を行ったが、失敗。ブルースは、怒りを感じて心拍数が200を越えると巨大な緑色のモンスター“ハルク”に変身する特殊体質となってしまう。それ以来、彼を利用しようとする軍の追跡を逃れ、身を隠して治療薬開発と細胞の解明に専念するブルース。しかし、ブルースの居場所が突き止められ、ロス将軍によって送り込まれた特殊部隊員ブロンスキー（ティム・ロス）らに包囲されてしまう。追い詰められたブルースは巨人へと変身し、部隊を壊滅させた。唯一生き残ったブロンスキーは、ハルクが兵士強化実験の成れの果てであることを知り、衰えた肉体を強化するために実験に志願するのだが…