世界最大級の天然ガスプラント“レガリア”の爆発事故から2年。仙崎大輔（伊藤英明）は自ら志願し、海難救助のエキスパートであり最も危険な事案に従事する「特殊救難隊」で後輩の吉岡（佐藤隆太）と共に海難現場の最前線にいた。
嶋副隊長（伊原剛志）の指導の下、日々激しい任務に就いていた2人だが充実した毎日を送っていた。大輔の妻・環菜（加藤あい）は2人目の子を身ごもり、吉岡にはキャビンアテンダントの美香（仲里依紗）という恋人が出来ていたのだ。
そんな折、美香の搭乗するジャンボ旅客機が羽田空港を目指し飛行中、エンジンが炎上し飛行が困難な状況に陥る。さまざまな救助案が検討される中、総合対策室の下川救難課長（時任三郎）は、夕闇が迫り視界が悪くなる状況の中で、前代未聞の東京湾への着水を提案する。しかし、海上着水に成功したとしても、ジャンボが浮かんでいられる時間はわずか20分。機体が沈む前に乗客乗員346名全員を助け出す事が出来るのか！？